Hrvatsko društvo za istraživanje raka (HDIR) ove godine ponovno organizira, sada već po deseti put, praktičnu radionicu “Uvod u molekulsko modeliranje“, na kojoj će bit prikazane računalne metode molekulskog modeliranja te njihova primjena u različitim istraživanjima.
Trodnevna radionica namijenjena je široj znanstvenoj zajednici i održat će se 13. i 14. 4. (ponedjeljak i utorak) na Institutu Ruđer Bošković u Zagrebu te 20. 4. (ponedjeljak) on-line.
Broj sudionika na radionici je ograničen na 17 te je potrebno donijet vlastito prijenosno računalo, uz obaveznu registraciju putem on-line obrasca dostupnog na:
Za sudjelovanje na radionici potrebno je na račun HDIR-a (IBAN HR5023600001102084564) uplatit kotizaciju u iznosu od 30 €. Kotizacija pokriva sudjelovanje na radionici, potvrdu o sudjelovanju te pauze za kavu 13. i 14. 4.
Cilj radionice “Uvod u molekulsko modeliranje (MM)” je upoznati istraživače i studente, koji u svom radu koriste eksperimentalne metode, s in silico metodama MM-a, posebice s njihovom primjenom u interdisciplinarnim istraživanjima molekularnih osnova bolesti i otkrivanju novih biološki aktivnih malih molekula, temeljenih na podacima (data-driven science). Prvi dan bit će predstavljeni pristupi i metode MM-a koji se često koriste za opis malih molekula – spojeva i makromolekula – proteina i nukleinskih kiselina, kao i baze spojeva i makromolekula u otvorenom pristupu PubChem, ChEMBL, PDB i AlphaFold. Polaznici će također saznati kako koristiti dostupne AI/ML alate za ADMET karakterizaciju potencijalno aktivnih spojeva. Drugi dan, praktični rad će uključiti korištenje baza PDB i AlphaFold, programa PyMOL za vizualizaciju te programa za molekulsko uklapanje, kako bi se dobio uvid u međusobne interakcije proteina i proteina sa spojevima.
