Kuzman Consulting od 10. do 14. studenoga 2025. u Biocentru organizira radionicu „Genomika u praksi“, namijenjenu početnicima koji žele naučiti kako se analiziraju genomski podaci.
Na radionici će se obraditi tipičan workflow analize genomskih podataka na primjeru analize diferencijalne ekspresije gena, što uključuje:
kratak uvod u NGS i NGS podatke
pretraživanje i dohvaćanje podataka iz javnih baza
analizu sekvenci na platformi Galaxy: quality control, priprema podataka, mapiranje i obrada rezultata
uvod u R i tidyverse: učitavanje i manipulacija podataka (cleaning, reformatting)
analizu ekspresije pomoću paketa DESeq2
osnovne statističke analize u R-u (distribucije, jednostavni testovi, izračun greške)
vizualizaciju rezultata u R-u (osnovni tipovi grafova, s naglaskom na prilagodbu za publikaciju)
Svaki će polaznik, uz asistenciju predavača, vlastoručno proći cijeli proces – od sirovih podataka do rezultata spremnih za prezentaciju. Kroz praktičan rad bit će objašnjeno kako prepoznati i ispraviti probleme u podacima, koristiti R za analizu i vizualizaciju te primijeniti suvremene alate za analizu ekspresije gena.
Radionicu će voditi bioinformatičari s dugogodišnjim iskustvom u znanstvenim istraživanjima i industriji: dr. sc. Maja Kuzman, Dunja Glavaš i Eva Pavlinek.
Cijena sudjelovanja iznosi 400 EUR, a u cijenu su uključeni coffee break i ručak.
Prijave su otvorene do 3. studenoga 2025., broj polaznika je ograničen.
Za dodatne informacije i prijave obratiti se na: boris@kuzmanconsulting.com
