Misija HDBMB je poticati i podržavati razvoj temeljnih i primijenjenih istraživanja te edukaciju u području biokemije i molekularne biologije kao i svim molekularnim znanostima o životu, pridonositi prepoznavanju njihove važnosti za industriju, zdravlje i ekologiju te se zalagati za njihovu promociju u široj društvenoj zajednici. Aktivnosti Društva usmjerene su na:
HDBMB se svojim aktivnostima nastoji pozicionirati kao vodeća znanstveno-stručna udruga u Republici Hrvatskoj koja skrbi o unaprjeđenju istraživačkih i edukacijskih aktivnosti u području molekularnih znanosti o životu kao i prepoznavanju njihove korisnosti za društvo u cjelini. Kroz zagovaranje važnosti suvremenih molekularnih znanosti o životu u široj znanstvenoj i općoj zajednici, HDBMB želi postati aktivni sudionik u vođenju politika i donošenju odluka relevantnih za unapređenje i razvoj molekularnih znanosti o životu u Republici Hrvatskoj.